El Bakumatsu fue una época en la que las almas de los jóvenes ardían de ansiedad por el futuro de su país. Takasugi Shinsaku, un soldado de la fortuna de Choshu, se acerca a la nave del gobierno con su camarada Katsura Kogorou en busca de un misterioso "reloj" con el poder de manipular el tiempo que teme que el gobierno desee conservar para sí mismo. En lugar de permitir que ese poder caiga en las manos equivocadas, Takasugi planea destruir el artefacto, pero al obtenerlo, el artefacto se lo roban rápidamente, lo que obliga a la pareja a seguir al misterioso ladrón a la sede del gobierno en Kioto. Sin embargo, cuando llegan a la capital, descubren que el gobierno ha sido derrocado y la deidad que Susanoo ahora reina en su lugar. Las calles de la ciudad y la gente en ellas son muy diferentes de lo que Takasugi y Katsura recordaban.
Es posible que los tiempos hayan cambiado pero su misión no: Takasugi y Katsura deciden restablecer el tiempo y salvar a su nación de las fuerzas infames que intentan secuestrarlo.