Después de que una misteriosa pareja atacara a Rukia Kuchiki y borrara sus recuerdos mientras estaba en Seireitei, Ichigo Kurosaki, un Soul Reaper sustituto, olvida brevemente a Rukia, hasta que Kon, un Underpod Mod-Soul, se la recuerda. Confundido, busca al dueño de la tienda de dulces de su pueblo, Kisuke Urahara, que les abre el camino a Seireitei. Ichigo se sorprende al descubrir que sus aliados en Seireitei, los Shinigami de la Sociedad de Almas, se han olvidado de él.

Llena de acción, Kimi no Na wo Yobu sigue a Ichigo y Kon en su lucha contra sus antiguos camaradas mientras buscan a la desaparecida Rukia y descubren a sus agresores antes de que ataquen de nuevo.