Hace seis meses, Lord Hugh Anthony Disward, también conocido como Huey, perdió a su excéntrico abuelo, Sir Wesley Disward, quien era un reconocido coleccionista de libros raros. El testamento de su abuelo afirma que, para heredar su mansión y todo lo que contiene, debe custodiar la Bibliotheca Mystica de Dantalian, un archivo que contiene conocimiento prohibido, y también cuidar a una misteriosa niña llamada Dalian.

Cuando Huey se instala en la mansión, un viejo rival de su abuelo organiza una reunión con él. Dalian, sabiendo que el rival es el asesino de Wesley, acompaña y descubre que el asesino está en posesión de un Libro Fantasma, un tomo maldito que Wesley intentó sellar. Cuando el libro pone a los dos en peligro, Huey descubre que la Bibliotheca Mystica de Dantalian y Dalian son una y la misma, y ​​le confía a Huey la clave para desbloquear el conocimiento almacenado en ella. Juntos, Dalian y Huey sellan el libro, y así comienzan una asociación poco probable a medida que resuelven los misterios causados ​​por otros Libros Fantasma.