Shidou Itsuka continúa con su búsqueda de Ratatoskr para encontrar Espíritus e intentar sellar sus poderes, todo ello mientras mantiene sus relaciones con los que ya había sellado. Además, a medida que aparecen nuevos Espíritus, debe someterse a pruebas más complicadas, todo ello para poner fin a nuevos desastres mientras descubre más sobre el origen de los Espíritus.