Después de cinco años de albergar sentimientos no expresados, el estudiante de secundaria Taiju Ooki está finalmente listo para confesar su amor a Yuzuriha Ogawa. Sin embargo, justo cuando Taiju comienza su confesión, una luz verde cegadora golpea la Tierra y petrifica a la humanidad en todo el mundo, convirtiendo a todos los humanos en piedra.

Varios milenios más tarde, Taiju despierta y encuentra que el mundo moderno es completamente inexistente, ya que la naturaleza ha florecido en los años en que la humanidad se ha detenido. Entre un mundo de estatuas de piedra, Taiju se encuentra con otro ser humano vivo: su amigo Senkuu, amante de la ciencia, que ha estado activo durante unos meses. Taiju aprende que Senkuu ha desarrollado un gran plan para lanzar el completo resurgimiento de la civilización con la ciencia. La fuerza de Taiju y el cerebro de Senkuu se combinan para forjar una formidable asociación, y pronto descubren un método para revivir a los petrificados.

Sin embargo, el plan maestro de Senkuu se ve amenazado cuando sus ideologías son desafiadas por aquellos que despiertan. Mientras tanto, la razón de la petrificación de la humanidad sigue siendo desconocida.