Frustrados de nuevo por Naraku, Inuyasha, Kagome Higurashi y sus amigos deben continuar su búsqueda de los pocos fragmentos de la Joya de Shikon que quedan, para que no se conviertan en una joya corrupta a manos de Naraku. Pero Naraku tiene sus propios planes para conseguirlas, y destruirá todo lo que se interponga en su camino, incluso a sus propios subordinados.

El peligro persistente e inquebrantable que representa Naraku obliga a Sango y Miroku a decidir qué es lo más importante para ellos: el uno para el otro o su deber en la batalla. Mientras tanto, Inuyasha debe decidir si su corazón está con Kikyou o con Kagome, antes de que el destino decida por él. En medio de la carrera por encontrar los fragmentos, Inuyasha y su hermano Sesshoumaru también deben resolver su disputa y cooperar para su enfrentamiento final con Naraku, ya que es una batalla que deben ganar para poner fin a su maldad y crueldad de una vez por todas.