Años después de que un antiguo mal fuera salvado de las profundidades del mar, Joutarou Kuujou se sienta pacíficamente en una celda de una cárcel japonesa. No ha cometido ningún crimen pero exige que no sea liberado, creyendo que ha sido poseído por un espíritu maligno capaz de dañar a los que le rodean. Preocupada por su hijo, Holly Kuujou le pide a su padre, Joseph Joestar, que convenza a Joutarou de que abandone la prisión. Joseph informa a su nieto que el "espíritu maligno" es de hecho algo llamado "Stand", la manifestación física del espíritu de lucha de uno que puede adoptar una variedad de formas mortales. Después de una fiera pelea con el amigo de Joseph, Mohammed Avdol, Joutarou es forzado a salir de su celda y comienza a aprender a controlar el poder de su Stand.

Sin embargo, cuando un Stand despierta dentro de Holly y amenaza con consumirla en 50 días, Joutarou, su abuelo y sus aliados deben buscar y destruir al vampiro inmortal responsable de su condición. Deben viajar al otro lado del mundo, a El Cairo, Egipto y en el camino, luchar contra los feroces usuarios de Stand que quieren frustrarlos. Si Joutarou y sus aliados fallan en su misión, la humanidad está destinada a un destino sombrío.