Midgar, academia sólo para chicas, habría destacado sólo por la acción de aceptar a su primer y único estudiante masculino, Yuu Mononobe. Pero Midgar destaca por mucho más que eso: es una escuela exclusiva para un grupo de chicas conocidas como D's. Cada una de ellas tiene habilidades extremadamente poderosas para generar materia oscura y manipularla en poderosas armas.

Las D's no existían hace veinticinco años, y sólo aparecieron después de que una serie de misteriosos y destructivos monstruos conocidos como "Dragones" empezaran a aparecer por todo el mundo. Extrañamente, tan repentinamente como aparecieron, desaparecieron. Tras su estela destructiva, algunas chicas empezaron a nacer con símbolos en el cuerpo y con poderes de naturaleza similar a los que ejercían los propios Dragones.

Ahora las D asisten a esta escuela, con la esperanza de aprovechar y utilizar sus poderes contra los Dragones. Yuu es su último miembro y es extraordinario por ser el único D masculino conocido que existe. Ahora debe forjar relaciones con las chicas que le rodean, incluida su hermana, separada desde hace tiempo, que también asiste a la escuela, y trabajar con ellas para investigar y eliminar la amenaza de los poderosos Dragones.