Siete años después de que la humanidad fuera devastada por una gran catástrofe, surge un faro de ciencia y prosperidad en la ciudad de Kamitsubaki. Pero acechando en sus sombras se encuentran los Tesseractors, monstruos nacidos de la oscuridad humana. Solo las Witchling, cinco chicas con voces que ejercen magia, se enfrentan a ellos. Con cada nota, luchan, no solo para proteger la paz de la ciudad, sino para sanar un mundo roto.