De repente, llegaron: alienígenas parásitos que descendieron sobre la Tierra y se infiltraron rápidamente en la humanidad introduciéndose en el cerebro de objetivos vulnerables. Estos seres insaciables adquieren el control total de su huésped y son capaces de transformarse en diversas formas para alimentarse de presas desprevenidas.

Shinichi Izumi, un estudiante de bachillerato de dieciséis años, es víctima de uno de estos parásitos, pero no consigue apoderarse de su cerebro, sino que acaba en su mano derecha. Incapaz de reubicarse, el parásito, ahora llamado Migi, no tiene más remedio que depender de Shinichi para mantenerse con vida. Así, la pareja se ve forzada a una coexistencia incómoda y debe defenderse de los parásitos hostiles que esperan erradicar esta nueva amenaza para su especie.