El año es 2050.
Un joven ingeniero llamado Derrida Yvain se hizo famoso gracias a su contribución al desarrollo de la "Máquina Autónoma DZ" en Rebuild, la compañía manufacturera fundada por su padre.
Un día, Derrida y su colega Nathan descubren una falla en las ZD e intentan advertir a su jefe, pero son ignorados. Aunque Derrida y Nathan son conscientes del peligro, a regañadientes deciden postergar la toma de medidas y, en cambio, acuden a la fiesta de cumpleaños de la hija de Nathan, Mage. Al día siguiente, después de disfrutar de un día tranquilo, Derrida y Nathan son atacados repentinamente por fuerzas desconocidas. Al final de la fuga, Derrida cae en una máquina de sueño frío y 10 años más tarde, se despierta a un mundo devastado en medio de una guerra. Mientras Derrida es atacada por un grupo de DZ fuera de control, casi se da por vencida, pero recuerda las últimas palabras de Nathan.

"Cuida de Mage".

A pesar del duro destino que ha caído sobre él, Derrida se pone en marcha para buscar a Mage.