Desde la muerte de sus padres, Shinpei Ajiro ha vivido con la familia Kofune y sus dos hijas -Mio y Ushio-. Aunque entonces abandonó su isla natal para continuar su educación en Tokio, Shinpei regresa después de que Ushio se ahogue trágicamente durante el intento de rescate de una niña. Durante el funeral, su mejor amigo le informa de los moratones encontrados alrededor del cuello de Ushio, lo que hace dudar de la causa de su muerte. Sospechando que se ha producido un asesinato, Shinpei reevalúa los últimos acontecimientos, pero los extraños incidentes no dejan de sucederse. La desaparición de personas y otros sucesos inexplicables llevan a Mio a recordar un viejo cuento popular que hace referencia a entidades llamadas "Sombras", que podrían no ser del todo fantasiosas. Supuestamente, un encuentro con la propia Sombra predice la muerte inminente de la persona. Enfrentándose al lado oscuro de la isla Hitogashima, Shinpei se enfrenta a su sombrío destino para cumplir la última voluntad de Ushio: proteger a Mio.