Tomoya Okazaki es un delincuente al que la vida le parece aburrida y cree que nunca llegará a nada. Junto con su amigo Youhei Sunohara, falta a clase y planea malgastar sus días de instituto.

Un día, mientras se dirige a la escuela, Tomoya se cruza con una joven que murmura en voz baja. Sin previo aviso, ella exclama «¡Anpan!». (una comida popular japonesa), lo que llama la atención de Tomoya. Pronto descubre que la chica se llama Nagisa Furukawa y que exclama cosas que le gustan para motivarse. Nagisa afirma que ahora son amigos, pero Tomoya se aleja pasando el encuentro por nada.

Sin embargo, Tomoya se da cuenta de que cada vez se fija más en Nagisa en la escuela. Finalmente, acepta y se hace amigo de ella. Tomoya se entera de que Nagisa se ha retrasado un año debido a una grave enfermedad y que su sueño es revivir el club de teatro de la escuela. Alegando que no tiene nada mejor que hacer, decide ayudarla a conseguir este objetivo junto con la ayuda de otras cuatro chicas.

A medida que Tomoya pasa más tiempo con las chicas, aprende más sobre ellas y sus problemas. Mientras intenta ayudar a cada chica a superar sus respectivos obstáculos, empieza a darse cuenta de que la vida no es tan aburrida como pensaba.