Cuando el desaparecido Zero Kiryuu regresa a la Academia Cross, Yuuki Cross se siente aliviada al verlo a salvo, pero descubre que Zero ha cambiado en más de un sentido. Como resultado de las decisiones que tomó, Zero está plagado de visiones, y trata de descubrir la razón detrás de ellos, sin saber que las respuestas pueden estar mucho más cerca de lo que piensa.

Pronto, Yuuki también comienza a ser atormentada por horribles alucinaciones, y busca una explicación sobre su oscuro pasado en la única persona que puede aportarle claridad: Kaname Kuran, el vampiro de sangre pura más cercano a su corazón. Pero, ¿qué ocurrirá cuando por fin se revele la verdad?